Здравствуйте! Во-первых, нужно явиться с документами (паспорт, ИНН) в налоговую инспекцию, по тому адресу, куда Вас вызвали (либо позвонить по указанному в протоколе телефону) для выяснения обстоятельств и дачи объяснений. Если за нарушение, о котором составлен протокол, не является штрафным, с Вас возьмут только объяснение. Если данное нарушение не является штрафным, а Вы не заявили о себе, Вам придет штраф.
Если это нарушение штрафное, Вы можете взять непосредственно в налоговой инспекции реквизиты для оплаты и оплатить, либо на сайте госуслуг, зарегистрировавшись там. Желательно потом предъявить налоговую квитанцию об оплате