Если покупка квартиры оплачена жилищным сертификатом военнослужащего по программе «Военная ипотека», то разделу после развода она не подлежит. Здесь подразумевается, что 100% стоимости квартиры оплачены за счет военной ипотеки. Держатель сертификата будет признан единственным собственником. См. Федеральный закона. № 117-ФЗ «О накопительно-ипотечной системе жилищного обеспечения военнослужащих» от 20 августа 2004 г. и постановление Правительства РФ № 370 «О порядке ипотечного кредитования участников накопительно-ипотечной системы жилищного обеспечения военнослужащих» от 15 мая 2008 г.
Посмотрите что написано в свидетельстве права собственности (доли или общесовместная). Если доли - то как указано, если общесовместная - то суд определит, как делится квартира после развода, учитывая все обстоятельства, вклад второго собственника и равные права обеих сторон на часть жилья, оплаченную совместно нажитыми средствами.